{"id":79694,"date":"2021-03-20T11:28:49","date_gmt":"2021-03-20T11:28:49","guid":{"rendered":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/2021\/03\/20\/une-traque-bidonnee-delim-monde\/"},"modified":"2021-03-20T11:28:49","modified_gmt":"2021-03-20T11:28:49","slug":"une-traque-bidonnee-delim-monde","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/2021\/03\/20\/une-traque-bidonnee-delim-monde\/","title":{"rendered":"Une traque bidonn\u00e9e de\u00a0l’im-Monde<\/em>"},"content":{"rendered":"

Une traque bidonn\u00e9e de l’im-Monde<\/em><\/h2>\n<\/p>\n

Depuis le d\u00e9but de l’\u00e9pid\u00e9mie due au SARS-Cov2, le monde scientifique se penche sur l’origine du virus pendant que se diffuse dans l’opinion la possibilit\u00e9 que le virus r\u00e9sulte d’une intervention humaine, d\u00e9lib\u00e9r\u00e9e ou accidentelle.<\/p>\n<\/p>\n

Cette pand\u00e9mie toujours \u00e9volutive non (encore) contr\u00f4l\u00e9e plus d’un an apr\u00e8s son apparition oblige la plupart des gouvernements \u00e0 imposer des mesures sociales afin de r\u00e9duire la circulation virale. Port de masque en public, distanciation physique, couvre-feux et confinements, en l’absence de traitements efficaces quel que soit le stade de la maladie et d’une couverture vaccinale protectrice permettent de ralentir la progression du virus, d’\u00e9taler dans le temps les contaminations et ainsi d’\u00e9viter une surcharge des structures sanitaires, fort an\u00e9mi\u00e9es par les purges astringentes des aust\u00e9rit\u00e9s budg\u00e9taires. Ce dispositif non m\u00e9dical contraignant, tout \u00e0 fait inhabituel, a des cons\u00e9quences \u00e0 la fois \u00e9conomiques et socio-psychologiques importantes. Une r\u00e9cession de pr\u00e8s de 10% affecte les PIB de la plupart des pays. Les r\u00e8gles qui entravent les d\u00e9placements et les r\u00e9unions instituent des changements de mode de vie p\u00e9nibles. Elles majorent la suspicion \u00e0 l’\u00e9gard des gouvernements qui multiplient depuis plus d’une d\u00e9cennie des lois liberticides dans un contexte de marasme \u00e9conomique mondial bien ant\u00e9rieur \u00e0 l’actuelle crise sanitaire et que l’on peut faire remonter \u00e0 l’effondrement boursier de 2008. Cette atmosph\u00e8re est propice \u00e0 l’\u00e9mergence de th\u00e9ories qui attribuent au g\u00e9nie de l’homme la cr\u00e9ation de ce virus et de sa propagation. Les r\u00e9futer peut s’av\u00e9rer difficile d’autant que les scientifiques se sont discr\u00e9dit\u00e9s par une pratique de fraudes assez r\u00e9pandue dans leurs publications connue du public et qu’\u00e0 l’\u00e8re du post-modernisme, on n’attend plus de la science qu’elle d\u00e9livre de v\u00e9rit\u00e9s ultimes quand toutes les opinions sont r\u00e9put\u00e9es s’\u00e9quivaloir. De plus, le recul du financement public dans la recherche oblige les \u00e9quipes \u00e0 trouver des ressources aupr\u00e8s de firmes priv\u00e9es qui peuvent orienter les r\u00e9sultats mais aussi la nature des travaux selon leurs int\u00e9r\u00eats.<\/p>\n<\/p>\n

Le 22 d\u00e9cembre 2020, le quotidien de r\u00e9v\u00e9rence, L’im-Monde<\/em> en lettres gothiques offrait \u00e0 ses abonn\u00e9s un article<\/a> d’ « enqu\u00eate » sur le SARS-CoV-2 avec trois assertions dans le titre : Le silence de la Chine, un virus rep\u00e9r\u00e9 d\u00e8s 2013 et la fausse piste du pangolin. Rien que \u00e7a !<\/p>\n<\/p>\n

Nous allons essayer de d\u00e9montrer combien ces affirmations sont partiales et orient\u00e9es vers un besoin pentagonesque de ferrailler avec une puissance \u00e9conomique rivale des Usa.<\/p>\n<\/p>\n

Il n’est pas le seul orphelin de la grande famille<\/p>\n<\/p>\n

Il est vrai que le Sars-Cov2 est encore orphelin. Il ne lui pas encore \u00e9t\u00e9 trouv\u00e9 un anc\u00eatre direct.<\/p>\n<\/p>\n

Les phylog\u00e9n\u00e9ticiens sont pourtant \u00e0 pied d’œuvre d\u00e8s janvier 2020, depuis que le g\u00e9nome de la souche Wuhan a \u00e9t\u00e9 s\u00e9quenc\u00e9. Il appartient \u00e0 la famille des Coronavirus, du genre B\u00e9ta et au sous-groupe des Sarbecovirus ou lign\u00e9e B. Des travaux<\/a> de 2018 portant sur l’\u00e9volution et les origines des principaux coronavirus humains \u00e9tablissaient leurs origines certaines ou probables. Parmi les coronavirus end\u00e9miques responsables d’infections respiratoires des voies a\u00e9riennes sup\u00e9rieures et inf\u00e9rieures parfois associ\u00e9es \u00e0 une gastro-ent\u00e9rite, le plus souvent b\u00e9nignes, pour deux d’entre eux connus et identifi\u00e9s depuis plus de cinquante ans, on ignore encore quel est l’h\u00f4te interm\u00e9diaire. <\/p>\n<\/p>\n

Le HCoV-229E d\u00e9crit en 1965 a \u00e9t\u00e9 r\u00e9cemment retrouv\u00e9 parmi des chauves-souris africaines, l’h\u00f4te interm\u00e9diaire en serait les cam\u00e9lid\u00e9s.<\/p>\n<\/p>\n

Le HCoV-0C43 d\u00e9crit lui aussi au milieu des ann\u00e9es soixante est pass\u00e9 des rongeurs aux bovins avant d’atteindre l’homme. Il est dou\u00e9 d’un certain tropisme pour le tissu neurologique.<\/p>\n<\/p>\n

Le HCoV-NL63 a \u00e9t\u00e9 d\u00e9crit en 2004 aux Pays-Bas, il a comme r\u00e9servoir la chauve-souris, on n’en connait pas l’h\u00f4te interm\u00e9diaire.<\/p>\n<\/p>\n

Enfin, le HCoV-HKU1 B\u00e9ta 2A d\u00e9couvert en 2005 \u00e0 Hong-Kong. Il est pass\u00e9 des rongeurs \u00e0 un h\u00f4te interm\u00e9diaire domestique encore inconnu avant de s’\u00eatre adapt\u00e9 \u00e0 l’homme.<\/p>\n<\/p>\n

Pour le SARS-CoV de 2002-2003, la forme virale \u00e0 laquelle fut attribu\u00e9e le saut d’esp\u00e8ce avait \u00e9t\u00e9 identifi\u00e9e chez la civette palmiste avec une homologie de s\u00e9quence de 99,52%. C’est \u00e0 l’occasion de cette \u00e9pid\u00e9mie partie du Sud de la Chine et \u00e9tendue sur une trentaine de pays que fut d\u00e9crit le syndrome de d\u00e9tresse respiratoire aigu qui a donn\u00e9 son acronyme au nom du virus. 8 000 personnes furent atteintes et pr\u00e8s de 770 en sont d\u00e9c\u00e9d\u00e9es. Des mesures sociales (mise en quarantaine des malades et des sujets contacts) drastiques ont pu mettre fin \u00e0 l’\u00e9pid\u00e9mie.<\/p>\n<\/p>\n

Le MERS-Cov a donn\u00e9 lieu \u00e0 une \u00e9pid\u00e9mie en 2012 au Moyen-Orient dont l’\u00e9picentre fut l’Arabie Saoudite. Le taux de mortalit\u00e9 y \u00e9tait encore plus important que pour le SARS-CoV, 30% \u00e0 40% versus 10% environ. Il s’agit \u00e9galement d’un B\u00e9ta Coronavirus situ\u00e9 sur l’embranchement 2 C. Il p\u00e9n\u00e8tre les cellules par un r\u00e9cepteur le DPP4 ou CD26, la dipeptidyl-peptidase 4 pr\u00e9sente dans les voies respiratoires avec un gradient de faible \u00e0 fort depuis les fosses nasales jusqu’aux alv\u00e9oles pulmonaires. Trois souches de MERS-Cov circulent entre l’homme et le dromadaire. La transmission interhumaine est faible, il faut un contact \u00e9troit et prolong\u00e9, ce qui a limit\u00e9 la port\u00e9e de cette maladie grave parvenue tout de m\u00eame jusqu’en Cor\u00e9e du Sud en 2015.<\/p>\n<\/p>\n

Sars-CoV et Sars-Cov2 appartiennent tous deux \u00e0 l’embranchement 2 B, ils se fixent au r\u00e9cepteur ACE2 tr\u00e8s ubiquitaire dans l’organisme des mammif\u00e8res. <\/p>\n<\/p>\n

Ce pr\u00e9ambule<\/a> permet d’aborder la question du Sars Cov 2 dont on ignore encore \u00e0 la fois l’h\u00f4te interm\u00e9diaire et le pr\u00e9curseur imm\u00e9diat. En effet, on peut encore ignorer l’h\u00f4te interm\u00e9diaire comme pour le virus HCoV-HKU1 connu depuis plus de cinquante ou le HCoV-NL63 d\u00e9couvert il y a seize ans sans qu’il soit n\u00e9cessaire de combler ces trous dans la connaissance par des suppositions malveillantes ou parano\u00efaques.<\/p>\n<\/p>\n

Les cousins lointains, de plus en plus proches<\/h3>\n<\/p>\n

Pr\u00e9cocement dans l’\u00e9pid\u00e9mie, il a \u00e9t\u00e9 mis en \u00e9vidence deux lign\u00e9es chez les chauves-souris qui pr\u00e9sentent des analogies de structure avec le SARS-CoV2, mais de mani\u00e8re insatisfaisante.<\/p>\n<\/p>\n

L’un des g\u00e9nomes les plus proches appartient \u00e0 la souche RaTG13 (*), l’identit\u00e9 entre les deux virus est tr\u00e8s imparfaite, de l’ordre de 96%. Cette distance importante de 4% fait dire aux phylog\u00e9n\u00e9ticiens qu’il a fallu cinquante ans d’\u00e9volution<\/a> pour aboutir \u00e0 Sars-CoV2.<\/p>\n<\/p>\n

Le g\u00e9nome complet d’une autre souche, le RmYN02 (**), a \u00e9t\u00e9 collect\u00e9 entre mai et octobre 2019 dans des grottes du Yunnan \u00e0 partir d’\u00e9chantillons provenant de 227 chauves-souris. Il montre des s\u00e9quences identiques \u00e0 93,3% au Sars-CoV2. Cette similitude atteint 97,2% dans les deux premiers tiers du g\u00e9nome mais il existe une divergence sur le tiers restant, en particulier sur la zone correspondant \u00e0 la prot\u00e9ine spiculaire.<\/p>\n<\/p>\n

L’analyse de l’origine repose sur des d\u00e9cennies de connaissance th\u00e9oriques sur les processus \u00e9volutifs mol\u00e9culaires. Elle montre<\/a> que le YmYN02 a une structure g\u00e9nomique compos\u00e9e \u00e0 la fois de segments de type Sars-CoV2 et de virus de chauves-souris. On y observe des signatures d’origine distincte attribu\u00e9es \u00e0 la pression de l’immunit\u00e9 de l’h\u00f4te.<\/p>\n<\/p>\n

Des scientifiques japonais ont identifi\u00e9 un nouveau coronavirus de chauves-souris baptis\u00e9 Rco-319<\/a>. Il appartient au m\u00eame clade que RaTG13 et Sars-CoV2 tout en ne partageant que 87% d’identit\u00e9 avec le responsable de l’\u00e9pid\u00e9mie actuelle. Les auteurs insistent sur le fait que les recherches d’anc\u00eatres pour Sars-CoV-2 peuvent se trouver ailleurs qu’en Chine. Les chiropt\u00e8res migrent par larges colonies dans tout l’espace asiatique et au-del\u00e0. Le s\u00e9quen\u00e7age du mat\u00e9riel recueilli en 2013 n’a \u00e9t\u00e9 effectu\u00e9 qu’en 2020, exactement comme ce fut le cas pour RaTG13 en Chine. Ce d\u00e9lai, banal pour les Japonais, a \u00e9t\u00e9 interpr\u00e9t\u00e9 par certains chercheurs occidentaux et des journalistes transform\u00e9s en enqu\u00eateurs comme une dissimulation mal intentionn\u00e9e de la part des virologistes de Wuhan !<\/p>\n<\/p>\n

De la m\u00eame fa\u00e7on, des chercheurs \u00e0 l’Institut Pasteur du Cambodge<\/a> ont s\u00e9quenc\u00e9 des \u00e9chantillons viraux de chauve-souris congel\u00e9s depuis dix ans. Ils ont trouv\u00e9 deux variants d’un virus proche du Sars-Cov2, nomm\u00e9s RshSTT182 et RshSTT200 qui pr\u00e9sentent une similitude de pr\u00e8s de 93%. <\/p>\n<\/p>\n

Un travail en pr\u00e9-publication, dat\u00e9e du 8 mars 2021, expose le r\u00e9sultat<\/a> de la collecte sur 342 chauves-souris vivantes et de s\u00e9quen\u00e7age des pr\u00e9l\u00e8vements buccaux et des mati\u00e8res f\u00e9cales et d’urine. Sur 24 g\u00e9nomes de coronavirus, 4 \u00e9taient nouveaux. L’un d’eux extrait depuis une chauve-souris Rhinolophus pusillus partage 94,5% de son g\u00e9nome avec le virus pand\u00e9mique, donc bien plus que le RaTG13.<\/p>\n<\/p>\n

Des auteurs tendent \u00e0 attribuer la faible incidence de la pand\u00e9mie dans les pays d’Asie \u00e0 une sorte d’immunit\u00e9 crois\u00e9e acquise vis-\u00e0-vis des sarbecovirus qui circulent \u00e0 bas bruit depuis longtemps dans cette aire g\u00e9ographique. Cependant, les approches qui tentent de situer le SARS Cov-2 dans l’arborescence phylog\u00e9n\u00e9tique donnent des r\u00e9sultats contradictoires<\/a> selon les m\u00e9thodes bio-statistiques utilis\u00e9es, horloge mol\u00e9culaire ou bien le classement hors groupe. Ainsi les preuves appuy\u00e9es uniquement sur la phylog\u00e9n\u00e9tique risquent de ne pas \u00eatre suffisantes pour identifier l’origine du virus.<\/p>\n<\/p>\n

L’insinuation perfide de L’im-Monde<\/em> qui a consist\u00e9 \u00e0 pr\u00e9senter le non s\u00e9quen\u00e7age imm\u00e9diat du RaTN13 comme une manœuvre de dissimulation d\u00e9lib\u00e9r\u00e9e est tout droit sortie d’un esprit pervers ou ignorant les pratiques des laboratoires charg\u00e9s d’\u00e9tablir des biblioth\u00e8ques de souches virales. Japonais et Cambodgiens ont bien remis \u00e0 plus tard le s\u00e9quen\u00e7age de leurs collections congel\u00e9es. Ce travail vraiment fastidieux ne s’accomplit que lorsqu’un int\u00e9r\u00eat \u00e9pid\u00e9miologique se pr\u00e9sente.<\/p>\n<\/p>\n

L’hybridation, sorte de reproduction sexu\u00e9e?<\/h3>\n<\/p>\n

L’une des difficult\u00e9s \u00e0 construire la g\u00e9n\u00e9alogie des coronavirus tient \u00e0 leur possibilit\u00e9 \u00e0 \u00e9voluer par hybridation, ce qui impose de ne pas se contenter seulement les tracer en suivant les mutations.<\/p>\n<\/p>\n

Les coronavirus mutent certes naturellement en raison des erreurs de copie qu’effectue leur ARN polym\u00e9rase Arn d\u00e9pendante (RdRp). Ils disposent dans leur abondant mat\u00e9riel g\u00e9n\u00e9tique, ils sont deux \u00e0 trois fois plus gros que les autres virus \u00e0 ARN simple brin, du codage pour une exonucl\u00e9ase qui limite les taux d’erreur au moment de la r\u00e9plication. Par mutation, il faut entendre d\u00e9l\u00e9tion, addition ou changement dans l’unit\u00e9 de base du g\u00e9nome, le ribonucl\u00e9otide. La RdRp des Coronavirus est dix fois plus rapide que ses analogues dans les autres virus, on suppose que c’est une adaptation au long travail de recopiage des 30 000 bases qui les composent.<\/p>\n<\/p>\n

Elle a aussi une autre particularit\u00e9. Elle est capable<\/a> de faire des ‘sauts’ d’un complexe de copie (ribosome et brin matrice \u00e0 recopier) \u00e0 un autre dans la cellule infect\u00e9e. Son mode d’action est discontinu, elle peut changer de matrice en cours de route. Cette capacit\u00e9 semble n\u00e9cessaire pour de tr\u00e8s longs g\u00e9nomes, elle conduit \u00e0 la production de morceaux de l’ARN g\u00e9nomique par un m\u00e9canisme de choix de copie. Ces morceaux sont ensuite utilis\u00e9s comme mod\u00e8les pour \u00eatre les pr\u00e9curseurs de ce qui sera traduit en prot\u00e9ines virales par la cellule infect\u00e9e.<\/p>\n<\/p>\n

La RdRp va entamer la r\u00e9plication d’un morceau d’Arn g\u00e9nomique, elle interrompt son travail et peut reprendre la r\u00e9plication sur une autre matrice où lui est pr\u00e9sent\u00e9 de copie le g\u00e9nome d’un virus variant diff\u00e9rent de celui de la premi\u00e8re matrice. Au final, elle aura assur\u00e9 la production d’un g\u00e9nome fait de l’assemblage de deux virus plus ou moins diff\u00e9rents. Ces sauts qui servent \u00e0 contr\u00f4ler l’expression g\u00e9nique sont \u00e0 l’origine des taux de recombinaisons tr\u00e8s \u00e9lev\u00e9s des coronavirus.<\/p>\n<\/p>\n

Pour le coronavirus de l’h\u00e9patite murine, on a pu observer jusqu’\u00e0 un taux de 25% de virus recombinants dans la prog\u00e9niture des cellules co-infect\u00e9es. Certains biologistes ont \u00e9t\u00e9 jusqu’\u00e0 postuler que la recombinaison ou l’hybridation pouvait \u00eatre une forme de reproduction sexu\u00e9e des virus.<\/p>\n<\/p>\n

L’article de L’im-Monde<\/em> a \u00e9t\u00e9 prompt \u00e0 relater des suppositions sur le d\u00e9c\u00e8s de trois mineurs sur six admis en 2012 \u00e0 l’h\u00f4pital de Kunming dans le Yunnan pour une pneumopathie atypique. Ces travailleurs \u00e9taient employ\u00e9s \u00e0 curer une ancienne mine de cuivre habit\u00e9e de chauves souris rhinolophes. La pneumopathie avait \u00e9t\u00e9 attribu\u00e9e \u00e0 une greffe fungique par les m\u00e9decins de cet h\u00f4pital. La d\u00e9couverte<\/a> d’un paramyxovirus \u00e0 haute capacit\u00e9 pathog\u00e8ne chez des rongeurs dans cette grotte en 2014 pourrait faire rectifier le diagnostic initial. L’im-Monde<\/em> rapporte l’opinion de chercheurs indiens qui pensent trouver dans la description clinique de ces patients une \u00e9vocation de la Covid-19. Une d\u00e9tresse respiratoire subaig\u00fce ressemble \u00e0 n’importe quelle autre, ind\u00e9pendamment de son \u00e9tiologie microbienne ou fungique. On peut supposer par ailleurs que des mineurs (puisque les suppositions semblent licites) soient atteints d’un certain degr\u00e9 de pneumoconiose, ce qui fait d’eux un terrain fragile.<\/p>\n<\/p>\n

En quatorze pages serr\u00e9es d’un roman de gare, lard\u00e9es de suppositions non \u00e9tay\u00e9es mais propres \u00e0 susciter une grande d\u00e9fiance vis-\u00e0-vis de la Chine et de ses chercheurs, l’auteur ne trouve pas opportun de d\u00e9velopper cet aspect si particulier de la recombinaison g\u00e9n\u00e9tique. Pourtant tous les virologues connaissent cette caract\u00e9ristique des coronavirus qui rend ardu leur suivi sur les embranchements et les lign\u00e9es.<\/p>\n<\/p>\n

Recombinaison saisie dans le vif<\/h3>\n<\/p>\n

La communaut\u00e9 des virologues a \u00e9mis l’hypoth\u00e8se<\/a> assez forte que la Sars-CoV2 devait r\u00e9sulter d’une hybridation (ou recombinaison) entre un descendant direct ou indirect du RaTG13 et d’une souche adapt\u00e9e au pangolin auquel il aurait emprunt\u00e9 son dernier tiers, la partie codant pour la prot\u00e9ine S et d’autres prot\u00e9ines non structurelles. Des travaux<\/a> ult\u00e9rieurs ont montr\u00e9 que le domaine de la prot\u00e9ine spiculaire qui se lie au r\u00e9cepteur ACE2 est le si\u00e8ge de ph\u00e9nom\u00e8nes de recombinaison fr\u00e9quents dans des isolats pr\u00e9lev\u00e9s chez l’homme, le pangolin et la chauve-souris. L’\u00e9volutivit\u00e9 de cette r\u00e9gion RBD doit correspondre \u00e0 un ph\u00e9nom\u00e8ne d’adaptation \u00e0 l’h\u00f4te.<\/p>\n<\/p>\n

Le 2 f\u00e9vrier 2021, Bette Korber, biostatisticienne qui a beaucoup travaill\u00e9 sur les variants de l’HIV \u00e0 l’universit\u00e9 de Los Alamos au Nouveau Mexique a fait une communication<\/a> sur un recombinant de Sars-Cov2 trouv\u00e9 dans sa base de donn\u00e9es chez un patient en Californie. Il s’agissait clairement d’une hybridation entre le B.1.1.1, le variant britannique et le B.1.429 connu comme le variant californien. Le Britannique avec sa d\u00e9l\u00e9tion ∂69\/70, coupl\u00e9 au californien avec sa mutation L425R, est plus transmissible. Il acquiert de plus une r\u00e9sistance aux anticorps de l’immunit\u00e9 naturelle ou acquise par les vaccins. Il n’est pas certain que ce virus soit \u00e0 l’origine d’un nouveau variant et qu’il ne s’agisse que d’un hybride ponctuel.<\/p>\n<\/p>\n

N\u00e9anmoins, ce genre de situation peut se r\u00e9p\u00e9ter en raison de la circulation importante et simultan\u00e9e de plusieurs variants si bien qu’une personne peut se trouver infect\u00e9e par deux virus diff\u00e9rents. Korber n’a jusque l\u00e0 mis en \u00e9vidence qu’un seul hybride parmi les centaines de milliers d’\u00e9chantillons dans sa base.<\/p>\n<\/p>\n

La curieuse insertion du site pour la furine<\/h3>\n<\/p>\n

Le Sars-CoV2 est le seul Sarbecovirus \u00e0 pr\u00e9senter une insertion de nucl\u00e9otides codant pour quatre acides amin\u00e9s qui donnent lieu \u00e0 un micro-environnement de pH alcalin dans la r\u00e9gion \u00e0 la jonction des deux sous-unit\u00e9s S1 et S2 de la prot\u00e9ine spiculaire S. Cette addition est le site d’intervention d’une enzyme, la furine qui va scinder la prot\u00e9ine spiculaire \u00e0 ce niveau et mieux exposer la r\u00e9gion de S2. Cette conformation pourrait optimiser la fusion des membranes virale et cellulaire et la p\u00e9n\u00e9tration du virus dans la cellule. Il est m\u00eame possible que ce soit l’acquisition de cette addition qui ait favoris\u00e9 le saut dans l’esp\u00e8ce humaine.<\/p>\n<\/p>\n

N\u00e9anmoins, le site de clivage de la furine (not\u00e9 PRRA) (***), s’il n’est pas pr\u00e9sent dans les autres Sarbecovirus, existe dans le MERS-CoV (lign\u00e9e C). Il est \u00e9galement retrouv\u00e9 dans d’autres Sars-CoV humains plus divergents comme le HKU1 (lign\u00e9e A), virus end\u00e9mique du rhume saisonnier. Il est probable que d’autres coronavirus avec ce type de sites de clivage polybasiques soient d\u00e9couverts \u00e0 l’avenir car la prot\u00e9ine en forme de spicule est fortement soumise \u00e0 des mutations, comme si elle \u00e9tait peu prot\u00e9g\u00e9e par l’exonucl\u00e9ase, ce qui l’autorise \u00e0 acqu\u00e9rir des performances accrues en infectiosit\u00e9.<\/p>\n<\/p>\n

Les cons\u00e9quences fonctionnelles de cette acquisition sont encore inconnues.<\/p>\n<\/p>\n

Dans le virus de la grippe aviaire, l’acquisition d’un tel site de clivage polybasique convertit les virus \u00e0 faible pouvoir pathog\u00e8ne en formes tr\u00e8s pathog\u00e8nes. Des exp\u00e9riences sur le Sars-Cov ont montr\u00e9 que l’insertion d’un site de clivage am\u00e9liore la fusion cellule-virus sans pour autant affecter l’entr\u00e9e du virus. Ceci est \u00e0 rapprocher de certaines mutations dans la r\u00e9gion de la spicule qui se lie \u00e0 ACE2. En th\u00e9orie, elles accroissent l’affinit\u00e9 d’un facteur 10 alors que dans la r\u00e9alit\u00e9 elles ne la modifient pas en raison d’encombrement st\u00e9rique qui l’emp\u00eachent. <\/p>\n<\/p>\n

Certaines \u00e9quipes suspectent cette s\u00e9quence d’\u00eatre responsable de la fusion des membranes des cellules alv\u00e9olaires entre elles, formant des synticium incomp\u00e9tents aux \u00e9changes gazeux, ce qui aggraverait son pouvoir pathog\u00e8ne.<\/p>\n<\/p>\n

L’exp\u00e9rimentation d’un mutant SARS-CoV2 cr\u00e9\u00e9 avec une d\u00e9l\u00e9tion<\/a> des acides amin\u00e9s PRRA sur des lign\u00e9es cellulaires a permis de monter qu’il se r\u00e9pliquait plus vite que le virus d’origine. Mais appliqu\u00e9 sur des souris transg\u00e9niques avec un r\u00e9cepteur ACE2 humain, il conf\u00e8re une maladie plus mod\u00e9r\u00e9e. Dans ce mod\u00e8le animal, les souris ayant \u00e9t\u00e9 expos\u00e9es au mutant sont prot\u00e9g\u00e9es vis-\u00e0-vis d’une infection ult\u00e9rieure par le virus d’origine.<\/p>\n<\/p>\n

Quelques auteurs se sont saisis de cette occurrence unique du site furine dans le SARS-CoV-2 pour enfourcher la th\u00e9orie d’une manipulation g\u00e9n\u00e9tique humaine, soit par l’introduction d\u00e9lib\u00e9r\u00e9e d’une telle s\u00e9quence, les instruments d’insertion et d’excision en biologie mol\u00e9culaires deviennent en effet de plus en plus pr\u00e9cis, soit par l’acquisition d’un gain de fonction par passages r\u00e9p\u00e9t\u00e9s des virus sur des cultures cellulaires.<\/p>\n<\/p>\n

Les biologistes savent reconnaître les points où des additions se font artificiellement, il n’en a pas \u00e9t\u00e9 trouv\u00e9 sur le SARS-CoV-2 de Wuhan.<\/p>\n<\/p>\n

Quant \u00e0 la d\u00e9rive par cultures extensives et r\u00e9p\u00e9t\u00e9es sur cultures cellulaires, il faudrait pouvoir disposer d’un squelette initial tr\u00e8s proche du responsable de la pand\u00e9mie pour l’effectuer. Or, justement, de cet anc\u00eatre-l\u00e0, le virus est orphelin et la communaut\u00e9 des scientifiques aussi.<\/p>\n<\/p>\n

En conclusion (provisoire), il serait judicieux de rappeler que l’on ne sait toujours pas comment s’est effectu\u00e9 le passage du singe \u00e0 l’homme du virus HIV. L’hypoth\u00e8se la plus probable consiste \u00e0 consid\u00e9rer qu’un passage \u00e0 bas bruit s’\u00e9tait effectu\u00e9 lors de la construction de la ligne de chemin de fer au Congo depuis le Cameroun lors de la colonisation. Les travaux d’infrastructure et les d\u00e9placements humains auxquels ont donn\u00e9 lieu la voie ferr\u00e9e ont certainement d\u00e9rang\u00e9 l’\u00e9cosyst\u00e8me d’un virus cantonn\u00e9 \u00e0 l’esp\u00e8ce simiesque avec quelques passages fortuits et ponctuels \u00e0 l’homme. L’exode vers les villes, la pauvret\u00e9, la promiscuit\u00e9 et le c\u00e9libat des migrants ont fait le reste. Il a fallu cependant attendre plus de trente ans, entre les ann\u00e9es cinquante et quatre-vingt pour qu’explose la pand\u00e9mie. Elle aurait r\u00e9sult\u00e9 d’une lente transformation du virus chez l’homme et de la conjonction de l’\u00e9volution des mœurs sexuelles et de consommation de drogues par voie intraveineuse. <\/p>\n<\/p>\n

Les chauves-souris qui sont le deuxi\u00e8me ordre le plus abondant des mammif\u00e8res apr\u00e8s les rongeurs sont le r\u00e9servoir d’un grand nombre d’esp\u00e8ces virales. Elles peuvent parcourir de tr\u00e8s grandes distances pour trouver un nouvel h\u00e9bergement. Elles le feront d’autant plus volontiers si elles sont d\u00e9rang\u00e9es dans leur lieu de r\u00e9sidence habituel. Elles rencontreront des animaux domestiqu\u00e9s ou non qui pourront contaminer l’homme.<\/p>\n<\/p>\n

La Chine proc\u00e8de \u00e0 la fermeture de fermes qui \u00e9levaient des animaux r\u00e9put\u00e9s sauvages que les Chinois aiment consommer. Elle subventionne les \u00e9leveurs pour les aider \u00e0 se reconvertir<\/a>. Les autorit\u00e9s avaient encourag\u00e9 les paysans \u00e0 pratiquer ce type d’\u00e9levage assez lucratif, en particulier dans les provinces du Sud, pour les sortir de la pauvret\u00e9. Aujourd’hui, le pari de faire disparaître dans ce pays la grande pauvret\u00e9 a \u00e9t\u00e9 gagn\u00e9 au cours de l’ann\u00e9e \u00e9coul\u00e9e selon le plan de d\u00e9veloppement \u00e9labor\u00e9 par l’État. Mais il est probable que ces animaux faisaient office de r\u00e9servoirs interm\u00e9diaires pour un grand nombre de virus pr\u00eats \u00e0 faire le saut d’esp\u00e8ce chez l’homme.<\/p>\n<\/p>\n

Enfin, il est urgent que cesse la d\u00e9sinformation mal intentionn\u00e9e prodigu\u00e9e par une presse de moins en moins lue, trop visiblement congruente avec les besoins politiques de ses propri\u00e9taires. À pratiquer sans discernement par des proc\u00e9d\u00e9s grossiers la suggestion qu’il est possible d’attribuer les origines de la pand\u00e9mie \u00e0 un Grand Autre aux Yeux Brid\u00e9s, sournois, cachottier et malveillant, l’im-Monde <\/em>contribue certainement \u00e0 l’atmosph\u00e8re d\u00e9j\u00e0 parano\u00efaque qui saisit \u00e0 la gorge des populations occidentales d\u00e9sinform\u00e9es en permanence par une classe de politiques d\u00e9loyaux. Ce proc\u00e9d\u00e9 se retourne contre ses auteurs car il accroît l’incr\u00e9dulit\u00e9 dans la doxa dominante qu’ils ont pour t\u00e2che de distiller.<\/p>\n<\/p>\n

Notes<\/h2>\n<\/p>\n

(*) Ra pour l’esp\u00e8ce de chauve-souris qu’elle colonise, Rhinolophus affinis, TG pour Tongguan, la ville de la province du Yunnan la plus proche de la grotte mini\u00e8re où les \u00e9chantillons furent pr\u00e9lev\u00e9s et 13 pour l’ann\u00e9e de pr\u00e9l\u00e8vement. La s\u00e9quence compl\u00e8te n’a \u00e9t\u00e9 publi\u00e9e qu’en mars 2020. Cette souche est parfois not\u00e9e BatCov RaTG13, ou BtRaTG13, Bt pour Bat, chauve-souris.<\/p>\n<\/p>\n

(**) RmYN02 : Rhinolophus malayanus 02 car un autre g\u00e9nome complet appel\u00e9 RmYN01 a pu \u00eatre s\u00e9quence \u00e0 partir des \u00e9chantillons de cette grotte.<\/p>\n<\/p>\n

(***) PRRA pour la succession des acides amin\u00e9s : proline, arginine, arginine et alanine. L’arginine est un acide amin\u00e9 basique.<\/p><\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"

Une traque bidonn\u00e9e de l’im-Monde Depuis le d\u00e9but de l’\u00e9pid\u00e9mie due au SARS-Cov2, le monde scientifique se penche sur l’origine du virus pendant que se diffuse dans l’opinion la possibilit\u00e9 que le virus r\u00e9sulte d’une intervention humaine, d\u00e9lib\u00e9r\u00e9e ou accidentelle. Cette pand\u00e9mie toujours \u00e9volutive non (encore) contr\u00f4l\u00e9e plus d’un an apr\u00e8s son apparition oblige la… <\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"comment_status":"","ping_status":"","sticky":false,"template":"","format":"standard","meta":{"neve_meta_sidebar":"","neve_meta_container":"","neve_meta_enable_content_width":"","neve_meta_content_width":0,"neve_meta_title_alignment":"","neve_meta_author_avatar":"","neve_post_elements_order":"","neve_meta_disable_header":"","neve_meta_disable_footer":"","neve_meta_disable_title":"","_jetpack_memberships_contains_paid_content":false,"footnotes":""},"categories":[31],"tags":[19686,3977,20794,20795,2711,2878,20796,11562,19689],"class_list":["post-79694","post","type-post","status-publish","format-standard","hentry","category-les-carnets-de-badia-benjelloun-1","tag-chauve-souris","tag-chine","tag-cobvid","tag-corionavirus","tag-le","tag-monde","tag-pangolin","tag-virus","tag-wuhan"],"jetpack_featured_media_url":"","jetpack_sharing_enabled":true,"_links":{"self":[{"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/79694","targetHints":{"allow":["GET"]}}],"collection":[{"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts"}],"about":[{"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/types\/post"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=79694"}],"version-history":[{"count":0,"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/posts\/79694\/revisions"}],"wp:attachment":[{"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=79694"}],"wp:term":[{"taxonomy":"category","embeddable":true,"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/categories?post=79694"},{"taxonomy":"post_tag","embeddable":true,"href":"https:\/\/new.dedefensa.org\/index.php\/wp-json\/wp\/v2\/tags?post=79694"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}